引起三七根腐病的原因很多，在田間表現的症狀也比較複雜，症狀不同通常是由不同的病原引起。根據目前掌握的資料看，引起三七根腐病的病原主要有真菌性病原和細菌性病原。
一、細菌性根腐：七農俗稱「綠臭」。主要發生於種苗移栽田，在出苗期間引起芽腐。該病在二、三年生三七整個生長期都有發生，一般在蘆頭與芽基結合處出現褐色水漬狀病變，繼而呈角狀向上蔓延，造成莖桿基部腐爛中空；病害發生初期在晴天中午很容易發現，植株地上部表現為急性萎焉，即葉片呈綠色萎焉披垂；在發病部位可以看到百色菌膿，聞有臭味。
二、真菌性根腐：三七真菌性根腐由於引起的病原種類不同，表現症狀也不同。主要有以下幾個類型：
1、黃腐：表現為地上部植株矮小，葉片黃化；地下部塊根初期根部末端受害，以後逐漸向內部擴展，受害病根呈黃色干腐，常可見黃色纖維狀或破麻袋片狀的殘留物。七農稱為「黃臭」。
2、塊根開裂：受害塊根表現為塊根開裂、黃褐色，地上部植株矮小。
3、受害塊根表現為髓部組織首先腐爛，而根部皮層仍相對完整。該病害在各年生三七上均有發生，但以二、三年生三七發病較為嚴重。在三七整個生長期間均有發生，但以3～5月份和9～10月份發病較為嚴重。出苗期間又以二年生三七發病嚴重，表現為芽部腐爛，受害部黃褐色，並可蔓延至莖桿基部，造成植株倒伏，地上部葉片仍為綠色。
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