目前代煎的中藥湯劑最常見的包裝是真空密封包裝，其次也可用患者自己提供的器皿來盛放。各家醫院和藥店在密封真空包裝袋上提示的藥液保存時間不盡相同。曾經有研究，將不同方劑在不同溫度條件下存放，觀察藥汁的變質程度。結果發現，溫度越高藥液變質越快，在氣溫較高的季節裡，室溫在25℃以上，一般湯劑保存不超過2天；如果冷藏，則一般可以保存7天。不同方劑在同一條件下變質程度差異也較大，若藥液內澱粉、蛋白質、糖類等含量較多，變質更快。
為了保證藥品使用安全，密封真空包裝的中藥湯劑保存的最佳溫度為0℃～5℃，保存時間為7～14天，但最好不要超過7天。一方面是因為湯藥煮好後，在拿回家冷藏前常有半天到一天的室溫保存，這會加速藥湯變質；另一方面，煎煮的藥湯裡若含有全蠍、蜈蚣等動物類中藥或熟地、黃芪等糖分含量較高的中藥，也會影響保存時間。若發現藥液袋鼓起或藥液變味，有氣泡等異常現象則屬變質，不可服用。
如果是用自己提供的器皿來盛放的中藥湯劑，一般不建議隔夜服用，即使放置在冰箱冷藏室中，也不應超過3天，以免藥液變質影響健康。
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