中藥復方在幾千年的醫療實踐中顯示出確切而獨特的療效。但由於其成分和作用機理的複雜性，對藥效作用的物質基礎、作用機理、配伍規律尚缺乏認識，從而嚴重制約了中醫藥科學內涵的深入揭示、復方中藥的二次開發和創新組方的研製。要通過探索名方、優化大方、衍生新方，對中藥二次開發，來研製療效確切、成分明確、機理清楚、質量可控的新型復方中藥。
當然，優化中藥復方有很多難點。首先，藥物復方需要從多組分、多劑量、多配比中優選。多變量、多指標的優化，工作量十分巨大。其次，中藥的辨證論治、隨症加減原則，使得臨床積累了大量的不同人群、不同組分、不同配比、不同劑量的個體化療效數據。最佳中藥復方理應從這些臨床數據中提取，而不應完全通過動物實驗篩選。但是，由於缺少方法學支撐，使之成為中醫藥臨床研究中的重大技術難題。另外，中醫證候療效反應總體疾病狀態，通常多由非特異性症狀群（如飲食起居等）表示，這些症狀群在敏感性和精確性上常難獲公認。
鑒於此，需要探索和發展中藥新藥研發的新思路和新模式。可以考慮基於模型的復方中藥研發，基於臨床個體化數據篩方的新模式，名方優化與成藥性研發新模式，中醫證候療效的生物學標誌物研究等。
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