銀杏樹性喜濕潤，但怕積水，苗木在水中浸泡3－4天就會死亡，在生產過程中必須注意排水和適時澆水。
一、灌水
銀杏各生長發育時期都需要有充足的水分。灌水根據樹體、降水量和土壤含水量等條件而定。具體要抓好以下時期的灌水：
萌芽前，在休眠期結束，芽萌動前，通常稱之謂「春灌」；花謝後，果實膨大，新梢迅速生長，對水分要求較高，多者可連續灌2次；果實發育，此時正值雨季，一般不需要灌水，但在乾旱年份仍要進行灌水。越冬前，在果實采後，樹葉變黃脫落、土壤封凍以前灌溉，促進花芽分化，增強樹體抗寒越冬能力。
二、排水
銀杏怕澇，根繫在積水15厘米深，連續10天，就會引起落葉和爛根，重者植株死亡。在選擇園地時，應注意地下水位在1－2米的地段，園地規劃時，設計好排水系統，即園地周圍開深溝，園內每隔兩行開一條排水溝，明溝、暗溝都可以。山坡地的排水，可結合水平階、魚鱗坑、梯田等順溝排除。在根系分佈層的含水量達到土壤最大持水量時，就需要進行排水。
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